Федеральная налоговая служба (ФНС) совместно с Минтрансом защитили права заказчиков логистических услуг. Клиенты транспортно-экспедиторских компаний не потеряют право на вычеты по НДС и учет расходов по налогу на прибыль, если их партнер не попал в реестр из-за технических сбоев. Главное условие — экспедитор должен был отправить заявку на регистрацию вовремя.

Проблема возникла после 1 марта 2026 года, когда регистрация экспедиторов в специальном реестре стала обязательной. Из-за огромного потока документов государственные ИТ-системы столкнулись с высокой нагрузкой. Обработка заявок затянулась, и многие честные компании не успели вовремя появиться в списках. Бизнес начал опасаться, что налоговая инспекция автоматически аннулирует сделки с такими экспедиторами и доначислит налоги заказчикам.

Налоговое ведомство уточнило, что сам по себе факт отсутствия компании в государственном реестре не является поводом для наказания ее клиентов. Но для защиты налоговых льгот заказчик должен доказать добросовестность своего партнера.

Для этого экспедитор должен предоставить клиенту доказательства того, что он выполнил свои обязанности перед государством:

Электронное подтверждение с портала Госуслуг.

Документ должен четко фиксировать дату и время приема заявки сервером.

К уважительным причинам, по которым экспедитора могли не внести в реестр вовремя, министерства относят сбои государственных систем, перегрузку серверов и затягивание сроков проверки со стороны самих чиновников.

При этом ФНС предупреждает, что налоговые инспекции не перестанут проверять бизнес. Ведомство продолжит детально изучать реальность каждой перевозки по статье 54.1 Налогового кодекса РФ. Механизм защиты не сработает, если компании вели фиктивную деятельность, подавали ложные данные в реестр или пытались уйти от налогов.

Источник: logirus.ru